Die Initiierung und Publizierung von Forschungsvorhaben zur Geschichte des KZ Neuengamme und der Außenlager zählt zu den Aufgaben der KZ‑Gedenkstätte Neuengamme. Die Gedenkstätte kooperiert dabei mit zahlreichen PartnerInnen, mit Universitäten, Forschungsinstituten, Museen, anderen Gedenkstätten, Geschichtswerkstätten und Initiativen, insbesondere jenen, die zur Geschichte und Nachgeschichte des KZ Neuengamme und seiner Außenlager forschen. Forschungsprojekte der Gedenkstätte werden regelmäßig in den "Beiträge zur Geschichte der nationalsozialistischen Verfolgung in Norddeutschland", in den Neuengammer Kolloquien und den Neuengammer Studienheften vorgestellt.
Folgende Projekte werden derzeit im Archiv bearbeitet:
Folgende Projekte werden im Studienzentrum bearbeitet:
Die Abteilung "Sonderausstellungen und Gedenkstätten Hamburger KZ-Außenlager" der Stiftung Hamburger Gedenkstätten erarbeitet regelmäßig Sonderausstellungen. Diese Ausstellungen wurden erstmals im Rahmen des jährlichen „Tages des Gedenkens an die Opfer des Nationalsozialismus“ im Hamburger Rathaus gezeigt und können ausgeliehen werden: Gesamtliste
Die Stiftung Hamburger Gedenkstätten und Lernorte betreut weitere Drittmittelprojekte. Aktuell das Projekt "Serious Game. Die Kinder vom Bullenhuser Damm".